Tahun 2006, di Tokyo Prefectural Jujutsu High School, aula sekolah dipenuhi dengan perdebatan tanpa henti dan cekcok intens antara dua sahabat karib yang tak terpisahkan. Satoru Gojou dan Suguru Getou, yang dipenuhi dengan kepercayaan diri yang tak tergoyahkan, meyakini bahwa tak ada tantangan yang terlalu besar bagi penyihir Kelas Khusus muda dan kuat seperti mereka. Mereka diberikan tugas untuk mengawal seorang gadis bijaksana bernama Riko Amanai menuju entitas yang keberadaannya adalah inti dari dunia jujutsu. Namun, misi ini membawa mereka terjerumus dalam pusaran konflik moral yang melelahkan, yang mengancam menghancurkan hubungan rapuh antara penyihir dan manusia biasa.
Dua belas tahun kemudian, para siswa dan penyihir menjadi garis pertahanan terdepan melawan meningkatnya jumlah kutukan tingkat tinggi yang lahir dari emosi negatif manusia. Seiring dengan semakin kuatnya entitas-entitas ini, kesadaran diri dan ambisi mereka pun turut berkembang. Para kutukan bersatu dengan tujuan bersama untuk memusnahkan manusia dan menciptakan dunia yang hanya dihuni oleh pengguna energi kutukan, dipimpin oleh roh kutukan kuno yang berbahaya. Untuk menghilangkan hambatan terbesar mereka—penyihir terkuat, Gojou—mereka merancang serangan di Stasiun Shibuya pada malam Halloween. Terpecah menjadi beberapa tim, para penyihir masuk ke dalam pertempuran dengan tekad untuk mempertaruhkan segalanya demi melindungi orang tak bersalah dan sesama mereka.